More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1783 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 304 aa  620  1e-177  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  94.74 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0120  porphobilinogen deaminase  93.42 
 
 		 304 aa  584  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.375076 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  79.14 
 
 		 304 aa  487  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  59.47 
 
 		 342 aa  345  6e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  39.93 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  39.31 
 
 		 311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  38.19 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  43.72 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  44 
 
 		 526 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  40.68 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0050  porphobilinogen deaminase  38.52 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  37.93 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1398  porphobilinogen deaminase  38.08 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  38.46 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  37.55 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  36.61 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  40.84 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  40.47 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  37.12 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1454  porphobilinogen deaminase  40.89 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.179158  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  38.72 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  38.27 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  39.18 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  40.08 
 
 		 358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  34.8 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  36.74 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  38.8 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  35.57 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  38.25 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1022  porphobilinogen deaminase  39.75 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1707  porphobilinogen deaminase  36.61 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0124397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0542  porphobilinogen deaminase  39.33 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0630058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  37.79 
 
 		 542 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  36.93 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  36.98 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0701  porphobilinogen deaminase  36.43 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.141584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  36.98 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0944  porphobilinogen deaminase  37.37 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  36.98 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1786  porphobilinogen deaminase  39.13 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000138949  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  38.15 
 
 		 312 aa  158  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  36.54 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  36.88 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  37.41 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2984  porphobilinogen deaminase  36.51 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0968  porphobilinogen deaminase  38.13 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  hitchhiker  0.00994772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  38.25 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  36.49 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  38.93 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  40.31 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  39.92 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  40.24 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  36.36 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  39.43 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  39.11 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  38.37 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  38.71 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  38.06 
 
 		 324 aa  155  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  39.18 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  36.63 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  36.3 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  37.8 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  38.96 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  38.78 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  38.52 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  37.25 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  38.96 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  35.98 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  40.15 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  39.18 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  36.33 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1936  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0833928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  37.45 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  35.88 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  34.8 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  39.18 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  38.78 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  36.08 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>