More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0201 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  54.16 
 
 
563 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  58.22 
 
 
611 aa  673    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  55.16 
 
 
621 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  54.73 
 
 
584 aa  643    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  54.5 
 
 
590 aa  641    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  55.21 
 
 
593 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  100 
 
 
637 aa  1312    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  52.03 
 
 
638 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  50.81 
 
 
601 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  50.81 
 
 
601 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  52.93 
 
 
556 aa  613  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  50 
 
 
605 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  48.17 
 
 
652 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  48.17 
 
 
671 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  49.84 
 
 
604 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  48.17 
 
 
652 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  49.19 
 
 
619 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  50.94 
 
 
604 aa  585  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  46.72 
 
 
669 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  49.35 
 
 
589 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  49.19 
 
 
580 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  49.43 
 
 
605 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  51.44 
 
 
592 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  49.84 
 
 
594 aa  580  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  49.68 
 
 
621 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  46.56 
 
 
657 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  46.9 
 
 
642 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  47.01 
 
 
664 aa  572  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  51.11 
 
 
659 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  45.65 
 
 
672 aa  568  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  50.08 
 
 
606 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  47.77 
 
 
606 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  49.5 
 
 
607 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  47.95 
 
 
673 aa  561  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  48.12 
 
 
574 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  51.23 
 
 
579 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  48.96 
 
 
626 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  48.89 
 
 
572 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  47.83 
 
 
627 aa  548  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  45.67 
 
 
656 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  47.55 
 
 
566 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  44.5 
 
 
664 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  48.52 
 
 
561 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  45.07 
 
 
666 aa  537  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  48.61 
 
 
581 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  47.65 
 
 
594 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  47.48 
 
 
598 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  48.03 
 
 
605 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  49.82 
 
 
569 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  46.18 
 
 
602 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  45.28 
 
 
614 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  46.84 
 
 
606 aa  512  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  45.06 
 
 
630 aa  512  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  47.33 
 
 
606 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  46.09 
 
 
631 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  46.09 
 
 
631 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  44.61 
 
 
633 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  45.99 
 
 
604 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  46.57 
 
 
612 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  43.83 
 
 
568 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  45.66 
 
 
605 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  45.32 
 
 
600 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  43.04 
 
 
568 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  44.77 
 
 
564 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  44.73 
 
 
599 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  41.88 
 
 
568 aa  475  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  40.62 
 
 
680 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  56.23 
 
 
630 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  51.77 
 
 
640 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  49.19 
 
 
561 aa  372  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  35.47 
 
 
809 aa  313  5.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  33.62 
 
 
746 aa  284  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  38.92 
 
 
1064 aa  240  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  39.82 
 
 
803 aa  232  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  35.01 
 
 
946 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  38.56 
 
 
941 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  36.36 
 
 
871 aa  193  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  37.12 
 
 
705 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.07 
 
 
511 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  33.25 
 
 
521 aa  160  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  32.69 
 
 
506 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  32.79 
 
 
504 aa  156  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  33.13 
 
 
521 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  33.73 
 
 
518 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  33.73 
 
 
518 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  35.79 
 
 
521 aa  152  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  31.98 
 
 
477 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  33.54 
 
 
536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  35.86 
 
 
513 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  31.66 
 
 
498 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  35.02 
 
 
489 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  33.45 
 
 
478 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  30.27 
 
 
565 aa  133  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  29.45 
 
 
551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.17 
 
 
527 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  29.51 
 
 
508 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  42.31 
 
 
460 aa  127  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  42.54 
 
 
460 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  30.82 
 
 
460 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  44.2 
 
 
505 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>