More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2074 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  100 
 
 		 142 aa  287  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  69.72 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  45.39 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  45.07 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  47.52 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  45.07 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  42.55 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  41.84 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  44.19 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  43.55 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  36.99 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  36.36 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.03 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.34 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32.86 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 		 246 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 256 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  29.66 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  37.61 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.95 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  30.67 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.61 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.45 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  31.88 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.47 
 
 		 845 aa  70.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.57 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.81 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.37 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.19 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.31 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  30.28 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.85 
 
 		 877 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  29.66 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  27.86 
 
 		 309 aa  67  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  31.78 
 
 		 291 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.71 
 
 		 909 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  26.98 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  29.56 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  33.58 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.78 
 
 		 903 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  28.87 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  26.72 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  26.36 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  30.43 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  26.21 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 873 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.34 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  31.78 
 
 		 307 aa  63.5  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  32.85 
 
 		 223 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  28.15 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  30.22 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.03 
 
 		 873 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  34.48 
 
 		 494 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  31.34 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  27.91 
 
 		 907 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.54 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  31.16 
 
 		 379 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.56 
 
 		 710 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 875 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  27.13 
 
 		 300 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>