More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3166 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
483 aa  994    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
524 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
1426 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
603 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1914  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 
203 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.19709  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
1439 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
1078 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
878 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
608 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
1301 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  32.07 
 
 
637 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
873 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  41.34 
 
 
849 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 
472 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 
1265 aa  130  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
984 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
769 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 
653 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
909 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
1039 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 
376 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
931 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
768 aa  127  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2267  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 
576 aa  126  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0262742  normal  0.128517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
766 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
771 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
593 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
1253 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
1513 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  43.51 
 
 
1113 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
530 aa  124  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
1121 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
720 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
901 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  40.43 
 
 
837 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  30.2 
 
 
400 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
862 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
644 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
783 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
660 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
1111 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
789 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
619 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  43.26 
 
 
401 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  51.3 
 
 
196 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
1032 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  42.38 
 
 
812 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  36.7 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
781 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  42.55 
 
 
268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  44.7 
 
 
669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
656 aa  115  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
763 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  44.17 
 
 
440 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
896 aa  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  47.5 
 
 
186 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
886 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
544 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2004  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 
212 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
1425 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  43.17 
 
 
200 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  40.3 
 
 
477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  43.08 
 
 
402 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
765 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  38.57 
 
 
559 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
813 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
753 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  27.37 
 
 
474 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  44.63 
 
 
149 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
1039 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  40.46 
 
 
287 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
1276 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
906 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
1325 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
347 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  36 
 
 
980 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
2072 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  27.44 
 
 
461 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  31.46 
 
 
458 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  43.33 
 
 
127 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 
133 aa  96.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
764 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
737 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  33.11 
 
 
479 aa  90.1  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
657 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
991 aa  87.8  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
651 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
758 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  38.17 
 
 
178 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
596 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
1051 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
1045 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
759 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
477 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
473 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>