More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2576 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  49.59 
 
 
122 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  47.11 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  45.08 
 
 
130 aa  110  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  47.54 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 
499 aa  106  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
352 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  45.69 
 
 
429 aa  105  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.96 
 
 
498 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  45.83 
 
 
257 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  42.15 
 
 
131 aa  104  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  43.33 
 
 
340 aa  104  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.35 
 
 
701 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.22 
 
 
426 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.7 
 
 
953 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  44.35 
 
 
263 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  45.22 
 
 
380 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  44.17 
 
 
255 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.97 
 
 
455 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  42.5 
 
 
469 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
450 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.97 
 
 
455 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 
352 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
636 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
450 aa  99.4  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  43.97 
 
 
461 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
376 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
989 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 
238 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
343 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 
404 aa  97.4  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
355 aa  97.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
359 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.83 
 
 
704 aa  97.1  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  44.17 
 
 
316 aa  96.7  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
989 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
377 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
603 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
373 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0913  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000115879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
591 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
384 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
817 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  44.35 
 
 
458 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.66 
 
 
245 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
387 aa  90.9  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
472 aa  90.9  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  41.88 
 
 
273 aa  90.9  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.52 
 
 
701 aa  90.9  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
261 aa  89.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  38.98 
 
 
240 aa  89.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
182 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
571 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  42.5 
 
 
474 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
386 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
521 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  36.36 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 
249 aa  86.3  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  36.21 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  41.03 
 
 
265 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  38.46 
 
 
311 aa  84.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.88 
 
 
481 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 
337 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
258 aa  83.6  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4330  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.61 
 
 
194 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  37.5 
 
 
667 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.14 
 
 
457 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  39.13 
 
 
657 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.76 
 
 
561 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  39.32 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.9 
 
 
199 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  38.84 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5458  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.93 
 
 
582 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.336827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  36.67 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.66 
 
 
635 aa  77.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1609  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
463 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.672475  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 
429 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.21 
 
 
221 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  38.46 
 
 
207 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  38.98 
 
 
205 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.61 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.61 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.61 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.78 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.44 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.8 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.19 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  36.21 
 
 
798 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.21 
 
 
461 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  31.62 
 
 
191 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.61 
 
 
229 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.07 
 
 
650 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1441  LytTR family two component transcriptional regulator  34.96 
 
 
248 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.39 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>