211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1525 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 441 aa  863    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  58.49 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  95.4 
 
 		 260 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  80.97 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  98.85 
 
 		 174 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  87.71 
 
 		 179 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  71.78 
 
 		 169 aa  226  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  74.85 
 
 		 169 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 		 246 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  44.96 
 
 		 240 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  41.53 
 
 		 253 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 245 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  31.33 
 
 		 241 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  38.27 
 
 		 245 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 159 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  38.3 
 
 		 223 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  38.24 
 
 		 252 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  36.93 
 
 		 252 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  39.88 
 
 		 169 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  37.97 
 
 		 247 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 164 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  37.45 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  32.21 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 137 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  34.44 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 166 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  27.16 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 157 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 204 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 165 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 184 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 168 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 153 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  38.97 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 149 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  31.65 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 141 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 151 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  27.62 
 
 		 173 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 170 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  29.95 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 152 aa  51.2  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 134 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 252 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 151 aa  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  39.73 
 
 		 137 aa  49.7  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  31.87 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  31.39 
 
 		 158 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 147 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 147 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 158 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 169 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 166 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 147 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  41.94 
 
 		 134 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 154 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.53 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 156 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 157 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 166 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 151 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 170 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 		 218 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  32 
 
 		 174 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 156 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  31.82 
 
 		 351 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 142 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  30 
 
 		 155 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 138 aa  47  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 157 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  41.38 
 
 		 302 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.43 
 
 		 173 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  42.65 
 
 		 329 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 230 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  42.65 
 
 		 329 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48240  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.53 
 
 		 159 aa  46.6  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 141 aa  46.6  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.65 
 
 		 164 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  28.76 
 
 		 174 aa  46.6  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  27.43 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.24 
 
 		 159 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5378  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.01 
 
 		 159 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290228  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 151 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 168 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0319  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.24 
 
 		 159 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>