89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1383 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  98.86 
 
 		 615 aa  1263    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 615 aa  1275    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  28.97 
 
 		 293 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.33 
 
 		 270 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 		 276 aa  104  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  27.38 
 
 		 378 aa  97.4  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 		 298 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.33 
 
 		 275 aa  96.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.06 
 
 		 278 aa  96.3  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.47 
 
 		 979 aa  94.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.84 
 
 		 275 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.71 
 
 		 285 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  26.21 
 
 		 403 aa  89  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.67 
 
 		 907 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  33.33 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.6 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.9 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  29.03 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  26.06 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.92 
 
 		 850 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 		 305 aa  76.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  26.48 
 
 		 463 aa  76.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.57 
 
 		 666 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  35.62 
 
 		 540 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 		 1316 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.5 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  34.18 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.49 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 841 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  34.62 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.75 
 
 		 843 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.99 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  28.26 
 
 		 292 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 		 805 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.28 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.48 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 900 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.87 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.03 
 
 		 789 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  28.57 
 
 		 442 aa  60.1  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.64 
 
 		 717 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.46 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  30.97 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.94 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.94 
 
 		 711 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  28.68 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 		 612 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 1343 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  31.33 
 
 		 903 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  25.44 
 
 		 277 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.79 
 
 		 719 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 		 428 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.22 
 
 		 464 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.58 
 
 		 316 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  26.45 
 
 		 509 aa  54.7  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 		 871 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 898 aa  54.3  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.05 
 
 		 1106 aa  54.7  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 		 431 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.42 
 
 		 648 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  23.67 
 
 		 1160 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  29.05 
 
 		 328 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.75 
 
 		 302 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 		 562 aa  52.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  26.97 
 
 		 509 aa  51.6  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  24 
 
 		 633 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.59 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  28.06 
 
 		 297 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  32.65 
 
 		 325 aa  49.3  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.35 
 
 		 442 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 		 457 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.26 
 
 		 343 aa  47.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  23.46 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.59 
 
 		 590 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93753  predicted protein  35.92 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 		 531 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1604  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  29.73 
 
 		 205 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 499 aa  44.3  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 1687 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.12 
 
 		 501 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0128  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.86 
 
 		 1731 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 		 502 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 355 aa  43.9  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 890 aa  43.9  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>