More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1577 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  100 
 
 
447 aa  867    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  74.22 
 
 
449 aa  652    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  72.42 
 
 
447 aa  657    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  71.97 
 
 
447 aa  657    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  46.67 
 
 
455 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  43.92 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  41.34 
 
 
455 aa  295  8e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  41.34 
 
 
455 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  36.36 
 
 
455 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  40.47 
 
 
454 aa  275  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  40.68 
 
 
451 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  35.75 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  38.74 
 
 
455 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  36.16 
 
 
454 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  36.12 
 
 
454 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  35.85 
 
 
456 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  34.99 
 
 
449 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  33.49 
 
 
442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  34.55 
 
 
460 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  34.05 
 
 
451 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  35.01 
 
 
464 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  35.38 
 
 
456 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  35.17 
 
 
452 aa  226  6e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  35.17 
 
 
439 aa  226  6e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  34.8 
 
 
461 aa  223  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  35.7 
 
 
455 aa  222  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  31.09 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  33.71 
 
 
451 aa  219  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  32.05 
 
 
460 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  34.32 
 
 
462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  32.34 
 
 
440 aa  217  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  32.82 
 
 
452 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.31 
 
 
448 aa  210  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  36.47 
 
 
466 aa  209  7e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30.68 
 
 
496 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  35.32 
 
 
451 aa  206  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  34.55 
 
 
456 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  32.29 
 
 
460 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
461 aa  202  7e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.55 
 
 
460 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  30.64 
 
 
450 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  32.71 
 
 
467 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
466 aa  196  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  29.54 
 
 
466 aa  195  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  31.48 
 
 
458 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  31.22 
 
 
447 aa  193  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  31.22 
 
 
452 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  32.74 
 
 
461 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  28.7 
 
 
472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.69 
 
 
467 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  29.91 
 
 
496 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  33.64 
 
 
464 aa  186  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  30.16 
 
 
448 aa  186  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  33.48 
 
 
470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  31.17 
 
 
453 aa  182  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  28.82 
 
 
493 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.95 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.95 
 
 
450 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  29.71 
 
 
448 aa  179  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  32.27 
 
 
467 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  32.25 
 
 
455 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  29.89 
 
 
447 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
460 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  30.53 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.19 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  29.72 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  30.29 
 
 
456 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  29.23 
 
 
450 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  28.77 
 
 
448 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  28.74 
 
 
451 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  28.74 
 
 
451 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  29.54 
 
 
449 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  29.57 
 
 
459 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  32.89 
 
 
459 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  29.06 
 
 
449 aa  169  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.47 
 
 
448 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  31.53 
 
 
452 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  30.85 
 
 
445 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  28.85 
 
 
446 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.74 
 
 
451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  30.88 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  30.31 
 
 
459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  28.24 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.36 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.35 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  31.13 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  28.13 
 
 
451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
440 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  28.5 
 
 
451 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.76 
 
 
451 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  30.23 
 
 
454 aa  162  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  29.88 
 
 
455 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.9 
 
 
451 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.9 
 
 
451 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  28.84 
 
 
442 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.66 
 
 
451 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.66 
 
 
451 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.66 
 
 
451 aa  160  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.6 
 
 
451 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>