More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1157 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  100 
 
 
447 aa  875    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  72.36 
 
 
446 aa  643    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1523  citrate transporter  71.46 
 
 
446 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  72.43 
 
 
446 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  56.8 
 
 
448 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  54.92 
 
 
449 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2656  anion transporter  50.88 
 
 
414 aa  358  9e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000561885  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  40.81 
 
 
422 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  40.81 
 
 
422 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  40.81 
 
 
422 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  40.81 
 
 
422 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  40.33 
 
 
422 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0829  anion transporter  35.85 
 
 
422 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  35.61 
 
 
422 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  35.61 
 
 
422 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  35.61 
 
 
422 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5235  citrate transporter  29.43 
 
 
435 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.524079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1498  di- and tricarboxylate transporters-like  31.29 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3428  citrate transporter  29.35 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.253129  normal  0.494299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  40.72 
 
 
616 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  37.17 
 
 
588 aa  156  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  42.13 
 
 
609 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  39.29 
 
 
613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0405  di- and tricarboxylate transporters-like  30.15 
 
 
439 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  37.27 
 
 
604 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  36.08 
 
 
612 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  39.69 
 
 
512 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  42.13 
 
 
600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  37.37 
 
 
588 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  44.94 
 
 
612 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  43.02 
 
 
619 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  37.98 
 
 
621 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  38.95 
 
 
610 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  38.95 
 
 
630 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  28.15 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  38.42 
 
 
610 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  39.47 
 
 
609 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  29.45 
 
 
462 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  35.04 
 
 
623 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  30.14 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  33.04 
 
 
589 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  35.53 
 
 
611 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  27.63 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  28.02 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  38.27 
 
 
778 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  36.41 
 
 
589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  26.04 
 
 
457 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  40 
 
 
610 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  37.24 
 
 
610 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  38.61 
 
 
593 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  27.66 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  35.41 
 
 
592 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  25.91 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  28.8 
 
 
466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  27.33 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  28.24 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  26.38 
 
 
482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  37.75 
 
 
620 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  28.99 
 
 
460 aa  131  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  28.57 
 
 
467 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  37.63 
 
 
594 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  28.25 
 
 
466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  28.25 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  28.25 
 
 
466 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  28.57 
 
 
467 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  28.25 
 
 
466 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  28.44 
 
 
466 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 
607 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  31.8 
 
 
598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  30.52 
 
 
482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  27.56 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  27.38 
 
 
464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  36.04 
 
 
593 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  39.77 
 
 
627 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  25.36 
 
 
474 aa  126  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  32.47 
 
 
588 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  25 
 
 
473 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  36.7 
 
 
592 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  35.56 
 
 
619 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  31.88 
 
 
610 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  35.32 
 
 
592 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  27.75 
 
 
458 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  26.01 
 
 
455 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.58 
 
 
616 aa  124  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  37.24 
 
 
610 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  36.79 
 
 
588 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  37.24 
 
 
610 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  37.24 
 
 
610 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  37.24 
 
 
610 aa  123  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  37.24 
 
 
610 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  35.32 
 
 
592 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  37.24 
 
 
610 aa  123  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  37.24 
 
 
610 aa  123  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  37.24 
 
 
610 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  35.24 
 
 
620 aa  123  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  40 
 
 
591 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.88 
 
 
618 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  40.94 
 
 
593 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  38.27 
 
 
608 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  31.74 
 
 
588 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>