85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3716 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  100 
 
 		 129 aa  269  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  32.1 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.53 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  33.03 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.97 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  35.85 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  32.53 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  30.14 
 
 		 283 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  35.85 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  35.85 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  35.85 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  33.85 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  35.85 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.5 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  37.1 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  34.92 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  33.96 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  32.56 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  33.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  33.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  28.05 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  33.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  33.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  33.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  31.94 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  33.8 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  25.83 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 294 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  28.92 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  32.35 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.71 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  30.99 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  34.92 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.74 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.21 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  33.8 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  32.89 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 288 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.62 
 
 		 160 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 125 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.37 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.49 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  32.39 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2648  hypothetical protein  29.03 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.3221e-18  normal  0.298129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  34.43 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 		 131 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 203 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.36 
 
 		 127 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 145 aa  40  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>