13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2648 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.3221e-18  normal  0.298129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0703  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.82 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1985  cupin domain protein  35.85 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 114 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3085  hypothetical protein  33.96 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000829377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3029  hypothetical protein  33.96 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2975  hypothetical protein  33.96 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000359936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3327  hypothetical protein  33.96 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3297  cupin domain protein  33.96 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3305  cupin domain protein  33.96 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  29.03 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>