134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1520 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  47.99 
 
 
1515 aa  1353    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  100 
 
 
1538 aa  2960    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  32.09 
 
 
1550 aa  849    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  47.66 
 
 
1510 aa  1337    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  47.9 
 
 
1578 aa  1327    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  36.25 
 
 
2140 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  35.35 
 
 
2032 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  39.03 
 
 
1869 aa  358  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  37.82 
 
 
1404 aa  325  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  41 
 
 
1276 aa  314  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  34.27 
 
 
1276 aa  313  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  34.02 
 
 
1276 aa  310  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  35.97 
 
 
1441 aa  299  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  33.87 
 
 
1206 aa  296  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  33.7 
 
 
1423 aa  295  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  34.31 
 
 
1428 aa  288  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  35.43 
 
 
1463 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  35.07 
 
 
1463 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  29.39 
 
 
1448 aa  282  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  36.18 
 
 
1530 aa  278  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  35.05 
 
 
1451 aa  271  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  31.58 
 
 
1335 aa  270  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  38.09 
 
 
1084 aa  265  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  31.73 
 
 
1489 aa  241  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  35.2 
 
 
1501 aa  239  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  31.01 
 
 
1487 aa  229  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  25.3 
 
 
1424 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  26.75 
 
 
1319 aa  196  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  29.06 
 
 
1500 aa  169  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  30.37 
 
 
1395 aa  161  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  29.36 
 
 
1405 aa  157  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  28.82 
 
 
1396 aa  157  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  28.3 
 
 
1406 aa  154  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  22.97 
 
 
1462 aa  154  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  28.54 
 
 
1270 aa  148  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  30.81 
 
 
1783 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  25.13 
 
 
1448 aa  136  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  27.95 
 
 
1398 aa  131  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  25.49 
 
 
1392 aa  126  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  31.11 
 
 
1937 aa  125  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  32.76 
 
 
1362 aa  117  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  25.33 
 
 
1550 aa  109  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  29.19 
 
 
1377 aa  92.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  23.3 
 
 
1256 aa  85.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  33.5 
 
 
1434 aa  80.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  29.13 
 
 
1453 aa  79.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  27.84 
 
 
1292 aa  73.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  27.38 
 
 
1056 aa  74.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  28.27 
 
 
1346 aa  73.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.72 
 
 
1224 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  26.55 
 
 
1352 aa  73.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.48 
 
 
1206 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.36 
 
 
1224 aa  72.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.65 
 
 
1229 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  25.3 
 
 
1223 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  25.18 
 
 
1232 aa  70.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.19 
 
 
1226 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  25.18 
 
 
1224 aa  70.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.94 
 
 
1221 aa  69.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  23.7 
 
 
1221 aa  69.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.51 
 
 
1359 aa  69.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  22.88 
 
 
1401 aa  68.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  26.62 
 
 
1361 aa  68.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.12 
 
 
1473 aa  67.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.55 
 
 
1443 aa  68.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  23.64 
 
 
1443 aa  68.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  24.5 
 
 
1705 aa  66.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.49 
 
 
1319 aa  66.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.64 
 
 
1448 aa  66.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  25.15 
 
 
1243 aa  65.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.01 
 
 
1184 aa  64.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.01 
 
 
1184 aa  64.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.67 
 
 
1485 aa  62.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.14 
 
 
1435 aa  62.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  27.62 
 
 
1360 aa  62.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  27.62 
 
 
1358 aa  62  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  24.52 
 
 
1372 aa  62  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  24.52 
 
 
1372 aa  62  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  24.52 
 
 
1372 aa  62  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  24.52 
 
 
1372 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  24.52 
 
 
1372 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  24.52 
 
 
1372 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  24.52 
 
 
1372 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  22.78 
 
 
1325 aa  60.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  28.65 
 
 
1218 aa  60.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  25.2 
 
 
1378 aa  59.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  27.56 
 
 
1375 aa  59.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  24.43 
 
 
1485 aa  58.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.14 
 
 
1262 aa  58.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  25.11 
 
 
1346 aa  58.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1135  hypothetical protein  23.08 
 
 
859 aa  57  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  23.83 
 
 
1226 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.84 
 
 
929 aa  57  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  23.48 
 
 
1369 aa  56.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  24.02 
 
 
929 aa  56.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  26.98 
 
 
1285 aa  55.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  22.88 
 
 
1290 aa  55.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  23.39 
 
 
1392 aa  53.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  26.91 
 
 
1505 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4866  protein of unknown function DUF490  24.08 
 
 
1601 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>