208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1885 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  337  4e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  56.44 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  51.61 
 
 		 163 aa  180  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  55.1 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  42.77 
 
 		 294 aa  147  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  47.22 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  49.64 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  46.58 
 
 		 183 aa  140  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  48.57 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  51.08 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  45.45 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  45.39 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  46.94 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  47.92 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  48.25 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  48.97 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  44.44 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  42.67 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  47.86 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  43.66 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.85 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.85 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  43.07 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.72 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  40.88 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  43.62 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  43.18 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  41.79 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  39.05 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  37.18 
 
 		 205 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  40.79 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  42.97 
 
 		 311 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  40.15 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  37.68 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  37.58 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  40.91 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  42.06 
 
 		 145 aa  104  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  39.41 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  38.41 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  40.15 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  42.75 
 
 		 129 aa  101  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  39.86 
 
 		 241 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  41.27 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  42.31 
 
 		 271 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  45 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  35.66 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  38.06 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  39.39 
 
 		 145 aa  97.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  97.4  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  42.45 
 
 		 231 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  45.69 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  41.26 
 
 		 231 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  39.06 
 
 		 265 aa  95.5  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  37.78 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  40.58 
 
 		 230 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  40.58 
 
 		 232 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  36.17 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  40.32 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  42.5 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  40.83 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  47.17 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  41.98 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  37.21 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  44.34 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  41.84 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  35.47 
 
 		 235 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  40.58 
 
 		 230 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  37.16 
 
 		 251 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  42.02 
 
 		 163 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  34.01 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  38.52 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  33.54 
 
 		 238 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  50.98 
 
 		 133 aa  91.7  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.01 
 
 		 147 aa  90.9  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  40.32 
 
 		 163 aa  90.9  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  34.36 
 
 		 239 aa  90.9  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  34.16 
 
 		 240 aa  90.1  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  34.21 
 
 		 238 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  45.28 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  41.41 
 
 		 124 aa  89.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  39.52 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  43.4 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  39.86 
 
 		 231 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  40.5 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  31.82 
 
 		 235 aa  88.6  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  39.69 
 
 		 240 aa  88.2  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  40.83 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  41.18 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  40.34 
 
 		 153 aa  87.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  36.97 
 
 		 142 aa  87.4  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  45.83 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  38.31 
 
 		 233 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  32.26 
 
 		 235 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  85.5  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  35.14 
 
 		 245 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>