215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1047 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  39.91 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  39.81 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.38 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  45 
 
 		 145 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  43.28 
 
 		 145 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.12 
 
 		 143 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.12 
 
 		 143 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  44.2 
 
 		 151 aa  98.6  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  40.74 
 
 		 164 aa  97.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  36.96 
 
 		 151 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  44 
 
 		 332 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  41.27 
 
 		 138 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  37.59 
 
 		 144 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  41.35 
 
 		 150 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  40.15 
 
 		 161 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  46.3 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  41.67 
 
 		 142 aa  89  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  45.45 
 
 		 139 aa  89  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  36.72 
 
 		 167 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  41.35 
 
 		 175 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  42.52 
 
 		 138 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  39.84 
 
 		 165 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  39.55 
 
 		 166 aa  86.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.4 
 
 		 162 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  41.73 
 
 		 140 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  34.09 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  47 
 
 		 153 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  37.4 
 
 		 162 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  43.86 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  34.76 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  40.83 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  36.72 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  36.72 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  41.73 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  40.57 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  35.16 
 
 		 167 aa  81.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  37.14 
 
 		 162 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  39.68 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  36.76 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  39.57 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  40.71 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  38.06 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  34.59 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  39.31 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  35.34 
 
 		 173 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  37.88 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  37.7 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  34.59 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  35.94 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  34.43 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  38.71 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  43.69 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  34.78 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  32.45 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  33.61 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  33.12 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  31.47 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  37.7 
 
 		 153 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  33.58 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  35.56 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  33.86 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  38.28 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  37.6 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  32.58 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  31.61 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  35.03 
 
 		 160 aa  72  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  34.15 
 
 		 160 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  35.2 
 
 		 163 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.57 
 
 		 183 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  37.12 
 
 		 167 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  36.72 
 
 		 142 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  34.06 
 
 		 147 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  34.67 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  36 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  40.38 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  36.59 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  33.82 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  32.31 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.59 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  35.25 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  34.72 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  36.63 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  40.59 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  31.86 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  39.09 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  35.66 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  36.8 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  35.92 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  35.21 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  42.57 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  34.72 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>