More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0251 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  100 
 
 		 458 aa  892    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  45.88 
 
 		 492 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 487 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  41.77 
 
 		 465 aa  355  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 461 aa  353  5e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 456 aa  352  8e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 472 aa  352  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  41.23 
 
 		 465 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 		 466 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 453 aa  299  7e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  41.26 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 497 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  41.57 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 475 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  38.41 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 446 aa  289  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 479 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 463 aa  249  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.66 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 		 475 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.08 
 
 		 486 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.13 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 482 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 459 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 		 493 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 		 482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.77 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 470 aa  182  8.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 		 487 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.79 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.66 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.22 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 522 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  31.19 
 
 		 473 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 452 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.44 
 
 		 500 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 477 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  28.48 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.62 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 455 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 455 aa  166  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 455 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.78 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  31.08 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  31.08 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 501 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  31.08 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 462 aa  163  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  31.08 
 
 		 457 aa  163  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.8 
 
 		 455 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 457 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.08 
 
 		 504 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.16 
 
 		 511 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 478 aa  156  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 475 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  32.44 
 
 		 490 aa  156  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.73 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0999  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.77003  normal  0.0952773 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>