More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2242 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  100 
 
 		 497 aa  1027    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  58.75 
 
 		 642 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  45.05 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  43.75 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  43.89 
 
 		 507 aa  378  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  42.18 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  43.36 
 
 		 497 aa  360  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  38.97 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  36.71 
 
 		 483 aa  319  6e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  39.34 
 
 		 500 aa  309  9e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  36.82 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  37.75 
 
 		 492 aa  306  7e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  39.18 
 
 		 454 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  40.83 
 
 		 451 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  40.05 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  40.39 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  40 
 
 		 484 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  39.47 
 
 		 474 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  37.38 
 
 		 437 aa  263  6e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  34.79 
 
 		 413 aa  225  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  34.44 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  30.75 
 
 		 422 aa  189  9e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  33.6 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  32.93 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  32 
 
 		 422 aa  179  9e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  29.1 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  29.9 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  29.43 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  28.99 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  34.55 
 
 		 325 aa  114  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  27.99 
 
 		 1001 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  32.89 
 
 		 324 aa  110  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  26.9 
 
 		 892 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  32.44 
 
 		 320 aa  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  31.49 
 
 		 1092 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  32.52 
 
 		 348 aa  108  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  31.8 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  32.08 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  34.39 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  28.87 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  32.72 
 
 		 328 aa  98.6  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  32.41 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  33.49 
 
 		 329 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  31.67 
 
 		 322 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  32.55 
 
 		 326 aa  97.4  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  33.02 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  34.3 
 
 		 318 aa  96.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  31.6 
 
 		 329 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  29.21 
 
 		 330 aa  94.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  35.21 
 
 		 327 aa  94.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  29.22 
 
 		 326 aa  94  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  31.25 
 
 		 334 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  29.71 
 
 		 315 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  31.6 
 
 		 330 aa  90.5  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  30.95 
 
 		 341 aa  90.1  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  27.59 
 
 		 398 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  33.02 
 
 		 347 aa  89.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  29.89 
 
 		 316 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  30.7 
 
 		 323 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  28.87 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  31.39 
 
 		 387 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  30.7 
 
 		 289 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  28.45 
 
 		 315 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  27.75 
 
 		 332 aa  87.8  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  28.69 
 
 		 322 aa  87  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  29.31 
 
 		 942 aa  87  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  29.3 
 
 		 325 aa  86.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  29.68 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  28.7 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  31.51 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  27.55 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  21.12 
 
 		 571 aa  83.2  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  31.53 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  27.92 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  29.63 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  26.54 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.52 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  29.17 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  29.6 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  28.81 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  29.95 
 
 		 1015 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  29.8 
 
 		 235 aa  67  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  30.16 
 
 		 940 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.24 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  21.67 
 
 		 725 aa  63.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  28.57 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  29 
 
 		 993 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  23.78 
 
 		 631 aa  61.6  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  24.92 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  25.19 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.44 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0991  recombination factor protein RarA  24.65 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  24.69 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.17 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  26.56 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  23.61 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.92 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  24.64 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  22.01 
 
 		 548 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  26.34 
 
 		 578 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>