More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1155 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1155  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  100 
 
 		 407 aa  826    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  34.34 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.18 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  27.75 
 
 		 615 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  27.68 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.78 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.92 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  27.18 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.57 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.44 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  30.34 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.09 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3021  hypothetical protein  27.18 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0380667  normal  0.511265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  28.29 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  27.84 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  27.64 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.37 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  27.84 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.19 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  26.9 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  30.15 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  28.64 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.98 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.14 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  25.85 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  24.39 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 		 969 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.59 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  28.65 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  25.35 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  26.3 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  25.62 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  27.74 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  31.33 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  25.95 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  32 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  25.66 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  27.36 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  27.84 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.04 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  22.83 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  30.58 
 
 		 1113 aa  69.7  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.86 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.86 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.86 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  27.38 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  27.46 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.37 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  27.43 
 
 		 1040 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  26.41 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  23.31 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  26.57 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  30.67 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  27.43 
 
 		 1042 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  25.26 
 
 		 450 aa  67  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.65 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  25.26 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  23.11 
 
 		 1005 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  22.59 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  25.68 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  21.82 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1042 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  26.51 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.32 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  25.82 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  25.82 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  27.05 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  24.9 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  25.82 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  22.92 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  24.35 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  24.88 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.3 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  26.64 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  27.13 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  25.34 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  27.13 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  23.69 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  26.74 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  23.95 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  24.64 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  24.43 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.1 
 
 		 667 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 		 721 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.25 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  24.03 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  24.32 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  26.6 
 
 		 1078 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.09 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  30.38 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  24.68 
 
 		 1084 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  24.4 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  25 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  28.76 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  24.51 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>