More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1852 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 318 aa  627  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1432  hypothetical protein  47.57 
 
 		 529 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.177306  decreased coverage  0.000115076 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.848525  normal  0.937518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  46.88 
 
 		 818 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  33.96 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.67 
 
 		 784 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 649 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 4079 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.3 
 
 		 988 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  38.57 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  46.15 
 
 		 1056 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.17 
 
 		 462 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 178 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.07 
 
 		 1022 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 1192 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  42.11 
 
 		 706 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 		 461 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  37.33 
 
 		 560 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 1276 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 927 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.75 
 
 		 1056 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  32.53 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 202 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0025  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 197 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0226285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 1049 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.7 
 
 		 706 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 543 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  36.62 
 
 		 1240 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  38.03 
 
 		 576 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.75 
 
 		 504 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3839  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1138 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  36.25 
 
 		 518 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 		 836 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.25 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  34.29 
 
 		 729 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.41 
 
 		 582 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  37.5 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.83 
 
 		 1764 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3390  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 166 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 		 166 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.84 
 
 		 820 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 3560 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  31.96 
 
 		 205 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.73 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 213 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 406 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 		 248 aa  53.1  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  39.47 
 
 		 539 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 406 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  39.66 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0143  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 197 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.279427  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 286 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 152 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.06 
 
 		 183 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 565 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0703  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.247899  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  41.67 
 
 		 715 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 716 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.33 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.11 
 
 		 541 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  30.26 
 
 		 541 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1421 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 169 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 505 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.71 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 425 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 878 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1846  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.71 
 
 		 110 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.791736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.96 
 
 		 778 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 591 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>