More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0793 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.32 
 
 
1276 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
543 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
699 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.9 
 
 
560 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.14 
 
 
397 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.06 
 
 
836 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
243 aa  80.9  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.78 
 
 
1694 aa  80.9  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
562 aa  80.5  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
927 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
1192 aa  80.1  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.05 
 
 
707 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
878 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
250 aa  77  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 
784 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.71 
 
 
1007 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
452 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.46 
 
 
743 aa  75.5  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
4489 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.48 
 
 
538 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
361 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  37.86 
 
 
564 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  32.76 
 
 
1240 aa  74.7  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
329 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
388 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
388 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
4079 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
1276 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
3560 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
617 aa  71.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  32.84 
 
 
635 aa  71.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.01 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
716 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
574 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35 
 
 
810 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.08 
 
 
292 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  35.34 
 
 
623 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
711 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
602 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
280 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
279 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.03 
 
 
261 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
260 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
761 aa  67.4  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
512 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 
1979 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
3035 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
1094 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
515 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  30.43 
 
 
1138 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 
632 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.45 
 
 
730 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  29.55 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.36 
 
 
573 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
376 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.34 
 
 
784 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
649 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
523 aa  65.1  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
577 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 
818 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
687 aa  64.7  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  29.37 
 
 
398 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
352 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 
1056 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.87 
 
 
219 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 
297 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 
1056 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 
297 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
523 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  27.19 
 
 
581 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
371 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
344 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
296 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 
988 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
605 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  26.36 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  27.34 
 
 
390 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 
373 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
366 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
270 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.11 
 
 
542 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.27 
 
 
334 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
317 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
306 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  25.95 
 
 
391 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.58 
 
 
715 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
955 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
414 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
465 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
465 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
275 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
202 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.78 
 
 
1022 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>