More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0548 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  66.47 
 
 		 174 aa  244  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  65.32 
 
 		 176 aa  238  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  55.49 
 
 		 176 aa  201  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  51.2 
 
 		 174 aa  193  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  50.9 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  50 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  48.24 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  44.12 
 
 		 178 aa  163  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  42.26 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  41.07 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  40.48 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  41.67 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  40.48 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  47.92 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  41.07 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  41.07 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  40 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  35.12 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  37.87 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  39.06 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  39.2 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  37.5 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  36.36 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  38.79 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  37.99 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  38.75 
 
 		 196 aa  110  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  34.62 
 
 		 191 aa  110  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  34.52 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.46 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  34.78 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  35.23 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  32.92 
 
 		 196 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  32.9 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  35.86 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  37.93 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  35.86 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  34.48 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  33.79 
 
 		 177 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  33.12 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  32.3 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  33.1 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  33.1 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  33.1 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  35.37 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  33.1 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  33.78 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  33.79 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  32.41 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  30.52 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  33.77 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  32.14 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  32 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  30.82 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  31.72 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  31.72 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  29.76 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  31.72 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  31.72 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  34.25 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  33.1 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0490  50S ribosomal protein L6  31.03 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00133523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  32.53 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  29.93 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  33.79 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  31.97 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  28.85 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  33.79 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  29.93 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  31.29 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  33.79 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  31.43 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2617  50S ribosomal protein L6  31.43 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00663642  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  32.65 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  31.43 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  31.43 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  30.77 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  31.43 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  33.79 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3154  50S ribosomal protein L6  31.43 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0206863  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  32.86 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0448  50S ribosomal protein L6  30.92 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.935491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  32.48 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  31.43 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  31.72 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  30.61 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  31.97 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  31.97 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  31.97 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  31.72 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  32.87 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  30.13 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4228  50S ribosomal protein L6  30.13 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00495937  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0335  50S ribosomal protein L6  31.03 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000198862  hitchhiker  0.000458858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>