More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0280 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  71.35 
 
 		 188 aa  287  8e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  72.16 
 
 		 187 aa  276  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  71.59 
 
 		 187 aa  275  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  71.59 
 
 		 187 aa  275  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  48.11 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  47.89 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.96 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.57 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.62 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  42.86 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.32 
 
 		 176 aa  158  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.02 
 
 		 190 aa  158  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1391  DNA-directed RNA polymerase  47.22 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.18 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0728  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  45.11 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  40.34 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2207  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  42.39 
 
 		 189 aa  149  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  39.89 
 
 		 191 aa  144  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  42.54 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.418303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3454  DNA-directed RNA polymerase  41.53 
 
 		 191 aa  141  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1488  DNA-directed RNA polymerase  40.22 
 
 		 189 aa  138  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.462584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0568  DNA-directed RNA polymerase  42.19 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.686614  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  39.34 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.16 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  42.35 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.87 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1990  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.07 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  25.51 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  44.93 
 
 		 808 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  42.25 
 
 		 807 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  42.25 
 
 		 808 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  42.25 
 
 		 807 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  42.25 
 
 		 807 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  42.25 
 
 		 807 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  42.25 
 
 		 808 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  42.25 
 
 		 808 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  42.25 
 
 		 807 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19835  predicted protein  31.07 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  40.85 
 
 		 809 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  38.3 
 
 		 828 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  40.85 
 
 		 829 aa  61.2  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  35.42 
 
 		 771 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  35.42 
 
 		 770 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  32.43 
 
 		 821 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  42.65 
 
 		 752 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  36.17 
 
 		 819 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  40.85 
 
 		 824 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  35.48 
 
 		 833 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  34.12 
 
 		 838 aa  58.9  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  37.5 
 
 		 836 aa  58.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  33.03 
 
 		 818 aa  58.5  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  39.44 
 
 		 819 aa  58.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  39.44 
 
 		 833 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37948  predicted protein  25.32 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0428372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  36.99 
 
 		 830 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  33.33 
 
 		 834 aa  58.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  44.93 
 
 		 804 aa  58.2  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  40.58 
 
 		 817 aa  58.2  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3646  exoribonuclease R  37.36 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0692  exoribonuclease R  37.36 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3791  exoribonuclease R  37.36 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  38.03 
 
 		 826 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  32.41 
 
 		 758 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  33.64 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  39.39 
 
 		 808 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  39.39 
 
 		 806 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  39.39 
 
 		 808 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  39.39 
 
 		 804 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  39.39 
 
 		 810 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  38.75 
 
 		 880 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  39.39 
 
 		 806 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  39.39 
 
 		 812 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  39.39 
 
 		 808 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  39.39 
 
 		 806 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28240  RNA polymerase II subunit  25.5 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.18212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  39.39 
 
 		 792 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0576  ribonuclease R  37.8 
 
 		 749 aa  57  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  36.96 
 
 		 822 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35680  predicted protein  25.5 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4617  ribonuclease R  40.85 
 
 		 826 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  36.96 
 
 		 818 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  34.88 
 
 		 735 aa  55.5  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  36 
 
 		 810 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  38.03 
 
 		 770 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  34.07 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  34.07 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  34.07 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  34.07 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  37.31 
 
 		 758 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  34.07 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  34.07 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  34.07 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  36.96 
 
 		 818 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  34.07 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  34.07 
 
 		 813 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  37.88 
 
 		 814 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  34.67 
 
 		 829 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  29.73 
 
 		 812 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>