More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01888 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  100 
 
 		 644 aa  1340    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  48.66 
 
 		 631 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  47.56 
 
 		 654 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  45.23 
 
 		 639 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  44.98 
 
 		 641 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  43.69 
 
 		 686 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  43.57 
 
 		 665 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  43.93 
 
 		 665 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  42.11 
 
 		 765 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  41.57 
 
 		 774 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 778 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  43.54 
 
 		 683 aa  535  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  41.28 
 
 		 786 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  42.25 
 
 		 620 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  40.58 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  40.43 
 
 		 609 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  37.02 
 
 		 619 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  35.96 
 
 		 630 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  31.27 
 
 		 610 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.56 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  31.35 
 
 		 510 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.59 
 
 		 1021 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 		 838 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  27.77 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  27.56 
 
 		 528 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  29.75 
 
 		 610 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 588 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 499 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  29.2 
 
 		 610 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 587 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.09 
 
 		 1891 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  31.17 
 
 		 574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  28.42 
 
 		 564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.61 
 
 		 589 aa  138  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  27 
 
 		 584 aa  138  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  26.2 
 
 		 614 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.46 
 
 		 599 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 		 583 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  27.76 
 
 		 533 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  26.32 
 
 		 620 aa  134  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 524 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.27 
 
 		 574 aa  133  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.46 
 
 		 515 aa  132  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  28.03 
 
 		 571 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  27.11 
 
 		 558 aa  130  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.67 
 
 		 593 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  28.3 
 
 		 586 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  24.9 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  24.1 
 
 		 604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  28.37 
 
 		 586 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  28.32 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  28.37 
 
 		 586 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  26.63 
 
 		 582 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  27.56 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.12 
 
 		 2068 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 575 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 589 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.75 
 
 		 541 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  29.78 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 649 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.45 
 
 		 654 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  25.84 
 
 		 703 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  26.62 
 
 		 595 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.89 
 
 		 836 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  23.87 
 
 		 642 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.24 
 
 		 1855 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  27.21 
 
 		 586 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  25.52 
 
 		 545 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  27.49 
 
 		 593 aa  124  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  24.14 
 
 		 2638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.19 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.28 
 
 		 814 aa  122  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  24.06 
 
 		 752 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.23 
 
 		 562 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  27.82 
 
 		 586 aa  120  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  26.17 
 
 		 484 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  27.55 
 
 		 586 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  27.27 
 
 		 586 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  27.55 
 
 		 586 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  27.55 
 
 		 586 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  26.15 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  27.55 
 
 		 586 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.77 
 
 		 609 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.05 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  26.13 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  26.85 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  25.49 
 
 		 600 aa  118  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  27.62 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  27.27 
 
 		 586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  26.98 
 
 		 575 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  26.21 
 
 		 481 aa  117  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  26.09 
 
 		 586 aa  117  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  25.49 
 
 		 739 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  23.9 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  27.81 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  25.82 
 
 		 606 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  27.9 
 
 		 493 aa  114  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 486 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 		 576 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>