More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6824 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  66.58 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  63.02 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  65.8 
 
 		 390 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  62.13 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  63.08 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  59.57 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  59.57 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  61.08 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  53.26 
 
 		 417 aa  348  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  59.82 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  57.37 
 
 		 403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  53.13 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  53.37 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  55.9 
 
 		 407 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  55.9 
 
 		 407 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  55.9 
 
 		 407 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  52.33 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  57.22 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  57.07 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  52.52 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  52.43 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  49.87 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  45.92 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  51.45 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  46.65 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  51.61 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  54.34 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  55.52 
 
 		 417 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  57.53 
 
 		 390 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  38.21 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  45.45 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 426 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  30.36 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  30.36 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  30.36 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  30.36 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  30.36 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  30.36 
 
 		 394 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  32.09 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  31.42 
 
 		 405 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.33 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 401 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  33.14 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  32.96 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  30.45 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  28.11 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  28.89 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  29.95 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  26.08 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  31.55 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  28.42 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  29.21 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.59 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  31.15 
 
 		 408 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 407 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  31.27 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  30.08 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  31.23 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.85 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>