More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6631 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  88.17 
 
 		 169 aa  279  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  71.78 
 
 		 441 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  73.86 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  71.78 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  59.51 
 
 		 456 aa  181  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  34.69 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 327 aa  71.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  34.23 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  34.62 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 		 340 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  29.73 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 341 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  31.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  34.57 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  28 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  36.89 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  50.98 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  36.19 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  32.74 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  52.08 
 
 		 383 aa  48.5  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  44.78 
 
 		 329 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  45.76 
 
 		 302 aa  48.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  44.78 
 
 		 329 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  35.8 
 
 		 131 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.5 
 
 		 134 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 347 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  31.86 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  52.38 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  48.89 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.04 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 377 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  40.98 
 
 		 430 aa  47.4  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  26.14 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  45.31 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.96 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  26.14 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  27.68 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  34.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  41.79 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  31.53 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  27.19 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3018  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  37.5 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  38.16 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  39.68 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  35.44 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  45.76 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  42.62 
 
 		 258 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  43.66 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>