More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1482 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  92.04 
 
 		 231 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  63.39 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  53.5 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  59.73 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  51.68 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  51.3 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  47.58 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  52.42 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  46.33 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  46.49 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  41.7 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  45.38 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  52.63 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  40.87 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  44.1 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  43.23 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  45.91 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  43.17 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  43.3 
 
 		 268 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  40.72 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  42.41 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  52.67 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  40.71 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  45.98 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  40.45 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 		 150 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  41.05 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  34.45 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  48.9 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  33.04 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  33.05 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  40.85 
 
 		 197 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  33.93 
 
 		 665 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  40.21 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  34.54 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  33.04 
 
 		 613 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  34.44 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  34.65 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  34.01 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  31.65 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.2 
 
 		 494 aa  72  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  30.4 
 
 		 546 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 542 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 542 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.43 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.79 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.55 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  32.2 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.38 
 
 		 462 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.7 
 
 		 546 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  34.25 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  34.25 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.18 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.15 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.19 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  35.03 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.51 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  33.91 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  30.53 
 
 		 460 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  32.43 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  32.43 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  32.43 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  33.94 
 
 		 184 aa  62  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.91 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  32.64 
 
 		 324 aa  62  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  33.74 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  29.63 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.55 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  36.03 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  38.31 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  32.76 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  31.17 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  29.36 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  34.63 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.48 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.09 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2383  resolvase domain-containing protein  58.7 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  34.25 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.16 
 
 		 519 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  36.78 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  32.45 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  32.76 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  36.78 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  33.33 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  33.33 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  35.23 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3386  hypothetical protein  54.35 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  31.61 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  33.55 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  34.19 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  32.08 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 		 510 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>