More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2409 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 400 aa  778    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  63.34 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  42.05 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  38.54 
 
 		 363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  42.6 
 
 		 375 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  39.69 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  47.43 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  38.81 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  39.11 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  36.97 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.65 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  36.73 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  36.17 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  39.68 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  43.84 
 
 		 315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  42.31 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  36.34 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  33.03 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  35.37 
 
 		 406 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  33.81 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  32.39 
 
 		 412 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  33.98 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  32.64 
 
 		 423 aa  92.8  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  29.78 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  29.82 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  32.22 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  30.08 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  28.86 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  30.2 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  26.21 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  29.43 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.12 
 
 		 549 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  30.09 
 
 		 581 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.76 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.52 
 
 		 1087 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  27.05 
 
 		 705 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  29.92 
 
 		 512 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  31.53 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.03 
 
 		 700 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  28.06 
 
 		 692 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.34 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.34 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  34.7 
 
 		 583 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  31.66 
 
 		 693 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  29.52 
 
 		 1087 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.01 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  27.72 
 
 		 630 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.8 
 
 		 572 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.96 
 
 		 738 aa  72.8  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  30.56 
 
 		 708 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  32.95 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 		 642 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  30.99 
 
 		 846 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  30.22 
 
 		 781 aa  71.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  29.08 
 
 		 663 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  30.12 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  27.85 
 
 		 716 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  27.91 
 
 		 800 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  26.92 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  28.29 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.47 
 
 		 1051 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.08 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.59 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  30.24 
 
 		 694 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  32.99 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  29.43 
 
 		 643 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  29.31 
 
 		 670 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  29.31 
 
 		 667 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  29.36 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  30.89 
 
 		 708 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  35.05 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  32.44 
 
 		 1100 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  29.17 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.25 
 
 		 678 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.33 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  30.36 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  28.41 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.78 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.91 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  29.43 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  30.81 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  23.96 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.7 
 
 		 672 aa  66.6  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  30.42 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  30.42 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  30.42 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  29.15 
 
 		 817 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  29.15 
 
 		 817 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  25.1 
 
 		 612 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  23.77 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  28 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  28.08 
 
 		 591 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  28 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>