282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1718 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 142 aa  290  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  44.09 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 398 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  39.86 
 
 		 399 aa  89  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  40.31 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  39.37 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  36.92 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  37.93 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  28.33 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  32.73 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 209 aa  52.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  30.77 
 
 		 530 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.17 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  30.95 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  25.98 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  25.98 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.05 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  30.3 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  29.6 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  41.54 
 
 		 314 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  41.54 
 
 		 314 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4058  hypothetical protein  25.78 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.168022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  36.36 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  41.43 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  41.43 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  30.84 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  45.45 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  41.54 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  28.12 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  28.21 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  37.93 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>