More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1485 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1485  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.177737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  58.03 
 
 		 310 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  56.72 
 
 		 310 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  58.11 
 
 		 309 aa  332  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  56.08 
 
 		 308 aa  329  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  56.42 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  56.46 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  55.48 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  55.37 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  55.45 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  53.08 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  50.68 
 
 		 317 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  52.81 
 
 		 308 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  54.45 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  52.05 
 
 		 317 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  52.81 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  51.97 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  51.82 
 
 		 307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  41.03 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1078  dihydrodipicolinate synthetase  35.64 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3308  dihydrodipicolinate synthetase  37.37 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  28.18 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  32.49 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  27.87 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  31.23 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  29.96 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  28.15 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  30.82 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  30.1 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  30.6 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  30.94 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  30.9 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  29.96 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  32.61 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  28.99 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  29.15 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  29.76 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2133  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  28.47 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.68 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  26.09 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.48 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  30.48 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  24.41 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  29.69 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  29.71 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.36 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  26.15 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  28.42 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0033  dihydrodipicolinate synthase  23.02 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  27.3 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  23.93 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  23.79 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  31.31 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  26.99 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  26.75 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  26.75 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  27.54 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  26.94 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  23.81 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.52 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  32.52 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  27.83 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0609  dihydrodipicolinate synthetase  23.39 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.224973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  26.88 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  28.18 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  25.41 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  28.04 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  23.23 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  26.48 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  24.5 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  25.79 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  29.24 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  29.07 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  23.13 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>