169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3064 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  100 
 
 		 219 aa  410  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  60.19 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  46.83 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1002  Rhomboid family protein  50.51 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.873632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0158  Rhomboid family protein  51.2 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  38.69 
 
 		 310 aa  96.7  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1636  Rhomboid family protein  33.18 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  31.71 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  34.24 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  36.32 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  32.96 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  31.09 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  30.49 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  36.6 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  33.53 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  35.09 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  32.11 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  32.94 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  28.04 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30.84 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  34.94 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  27.69 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  38.71 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  28.04 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  31.75 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.88 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  28.66 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  32 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  31.01 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  35.4 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  30.46 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  34.94 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  30.86 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  25.4 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  29.95 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  33.55 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  31.82 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  32.45 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 360 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  28.76 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  34.81 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  29.75 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  32.31 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  28.76 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  28.76 
 
 		 260 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  31.07 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  33.56 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  30.67 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  29.38 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  30.68 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  32.68 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  30.81 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  32.89 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  33.93 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  32.68 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  32.68 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  32.68 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  30.51 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  32.76 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  28.67 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  37.65 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  25.39 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  32.76 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  32.24 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  36.42 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  28.3 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  26.57 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  26.57 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  29.84 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  29.84 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  33.15 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  29.84 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  31.43 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  26.57 
 
 		 182 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  32.05 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.19 
 
 		 342 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  29.19 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  25.66 
 
 		 273 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  26.57 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  26.57 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  28.3 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.19 
 
 		 342 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  31.68 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  33.12 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.67 
 
 		 278 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  32.18 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  35.71 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  33.72 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  28.95 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  25.87 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  29.8 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  28.93 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  31.37 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  29.86 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  32.65 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  31.31 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  32.59 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  39.73 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5125  Rhomboid family protein  37.8 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>