More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0546 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
578 aa  1133    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  47.58 
 
 
588 aa  209  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
426 aa  189  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
473 aa  183  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
483 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
991 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  41.26 
 
 
387 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 
511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
708 aa  167  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
858 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
516 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  35.14 
 
 
383 aa  145  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
739 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
729 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 
607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 
607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1531  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 
607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
450 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  33.75 
 
 
384 aa  106  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
748 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  31.05 
 
 
298 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
563 aa  103  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  34.78 
 
 
385 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  32.86 
 
 
337 aa  100  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
574 aa  99.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
1181 aa  97.4  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
603 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
1052 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
654 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2073  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.85 
 
 
785 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  31.94 
 
 
582 aa  92  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
1568 aa  91.3  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
472 aa  91.3  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
1042 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
562 aa  88.6  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.51 
 
 
814 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  28.64 
 
 
343 aa  87.8  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
385 aa  87.4  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
713 aa  87.4  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
466 aa  87  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  29.91 
 
 
557 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
920 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.74 
 
 
572 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  28.02 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3507  diguanylate cyclase  30.45 
 
 
487 aa  86.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  31.88 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3478  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.74 
 
 
782 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20667  normal  0.271629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3541  diguanylate cyclase  34.03 
 
 
501 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
663 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
466 aa  83.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
689 aa  82  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  29.91 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
973 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
700 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  29.17 
 
 
588 aa  81.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
598 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
800 aa  81.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 
725 aa  80.9  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  28.69 
 
 
605 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  30.56 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
713 aa  81.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4063  diguanylate cyclase  29.66 
 
 
594 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  30.04 
 
 
265 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
586 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
594 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
576 aa  79  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
625 aa  77.8  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
710 aa  77  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
361 aa  77  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  25.38 
 
 
842 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
941 aa  77  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
593 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
404 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
961 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
883 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1050 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
515 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
566 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
587 aa  75.1  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
644 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1427  sensor protein RstB  29.46 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
655 aa  74.7  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
903 aa  74.7  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
496 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
931 aa  74.3  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
1039 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
572 aa  74.3  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
618 aa  74.3  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
628 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3546  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
518 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  30.84 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>