68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0201 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  64.76 
 
 		 588 aa  771    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  68.35 
 
 		 583 aa  820    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  86.94 
 
 		 640 aa  1017    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  100 
 
 		 614 aa  1258    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  70.35 
 
 		 644 aa  819    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0015  helicase c2  22.9 
 
 		 655 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0747117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0007  helicase c2  20.95 
 
 		 653 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000554419 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  29.1 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1524  helicase c2  25.38 
 
 		 657 aa  99.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00208913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  26.42 
 
 		 807 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  27.59 
 
 		 798 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  27.46 
 
 		 773 aa  67.8  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  22.81 
 
 		 801 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  27.16 
 
 		 798 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  24.81 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  21.83 
 
 		 753 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  24.45 
 
 		 766 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  24.25 
 
 		 779 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  21.66 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  21.49 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  23.13 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.71 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  25.26 
 
 		 749 aa  57.4  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  22.86 
 
 		 798 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  22.07 
 
 		 775 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  21.87 
 
 		 772 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.36 
 
 		 790 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  21.72 
 
 		 575 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  27.5 
 
 		 787 aa  53.9  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.81 
 
 		 692 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  25.56 
 
 		 774 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.4 
 
 		 654 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.31 
 
 		 692 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.83 
 
 		 691 aa  50.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.53 
 
 		 710 aa  50.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  22.2 
 
 		 758 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  22.78 
 
 		 754 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.85 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  20.91 
 
 		 781 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.61 
 
 		 691 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.25 
 
 		 690 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.81 
 
 		 723 aa  48.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.94 
 
 		 690 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.94 
 
 		 690 aa  47.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  19.93 
 
 		 758 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.35 
 
 		 690 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.94 
 
 		 690 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  22.7 
 
 		 785 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  23.3 
 
 		 754 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  23.24 
 
 		 790 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  21.03 
 
 		 761 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  20.55 
 
 		 781 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.45 
 
 		 711 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  26.36 
 
 		 669 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.1 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  28.23 
 
 		 874 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.1 
 
 		 690 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  21.39 
 
 		 753 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  22.81 
 
 		 791 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.48 
 
 		 670 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.83 
 
 		 690 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.83 
 
 		 690 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.83 
 
 		 690 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  23 
 
 		 619 aa  43.9  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.42 
 
 		 690 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  26.69 
 
 		 855 aa  43.5  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  29.2 
 
 		 822 aa  43.5  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>