More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_02160 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 224 aa  463  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  57.56 
 
 		 222 aa  254  9e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  53.62 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  51.46 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  53.66 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  51.22 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  50.95 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  51.69 
 
 		 223 aa  224  8e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  50.48 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  51.44 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  52.2 
 
 		 225 aa  221  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  50.25 
 
 		 232 aa  217  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  50.97 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  48.51 
 
 		 222 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  50.49 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  49.51 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  48.04 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  47.6 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.06 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  50.26 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  45.67 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  44.44 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  45.54 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  42.23 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  44.66 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  42.86 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  44.88 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  45.28 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  45.28 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  45.1 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  42.38 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  44.5 
 
 		 206 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  43.9 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.38 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  44.86 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  41.78 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  40.85 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  36.82 
 
 		 232 aa  154  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  38.08 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.71 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  40.74 
 
 		 213 aa  148  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  42.49 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.97 
 
 		 254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  34.73 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  38.14 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  35.98 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  34.82 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  35.38 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  35.38 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  36.76 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  35.05 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  32.52 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  29.96 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  29.69 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  36.84 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  29.07 
 
 		 296 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.48 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  35.07 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  35.98 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  36.17 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.11 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.03 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  36.17 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  35.52 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  33.01 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  31.53 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  32.35 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  33.51 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  35.87 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.98 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  30.88 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  33.16 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  34.59 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.32 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  29.51 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.73 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  29.81 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.02 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  29.81 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.55 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.57 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.74 
 
 		 270 aa  90.1  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  30.26 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  28.78 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  32.65 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.67 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.89 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  26.73 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  27.96 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  27.96 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  27.96 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  27.96 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  27.96 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  27.96 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  27.96 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  25.66 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.19 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.96 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.42 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  28.49 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>