More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0479 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 
291 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  47.12 
 
 
300 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  49.66 
 
 
293 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  45.92 
 
 
297 aa  245  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  47.64 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  42.86 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  45.56 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  48.33 
 
 
301 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  47.08 
 
 
293 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  46.74 
 
 
344 aa  222  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  46.3 
 
 
291 aa  221  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  48.61 
 
 
371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  45.77 
 
 
359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  49.58 
 
 
328 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  45.7 
 
 
315 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  43.51 
 
 
304 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  47.24 
 
 
323 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  41.46 
 
 
308 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  43.97 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  41.46 
 
 
308 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  41.38 
 
 
342 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  41.63 
 
 
308 aa  209  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  39.02 
 
 
304 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  39.02 
 
 
314 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  39.24 
 
 
309 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  38.6 
 
 
306 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  42.41 
 
 
305 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  39.24 
 
 
309 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  38.68 
 
 
304 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  42.7 
 
 
310 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  42.41 
 
 
308 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  39.12 
 
 
300 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  40.55 
 
 
300 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  40.62 
 
 
301 aa  205  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  45.61 
 
 
308 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  42.26 
 
 
380 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  42.13 
 
 
307 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  46.06 
 
 
339 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  41.28 
 
 
293 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  40.91 
 
 
324 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  39.04 
 
 
301 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  40.91 
 
 
324 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  40.91 
 
 
324 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  39.04 
 
 
301 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  46.48 
 
 
289 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  39.02 
 
 
305 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  44.12 
 
 
302 aa  203  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  39.42 
 
 
317 aa  202  5e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 
318 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  47.48 
 
 
311 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  46.06 
 
 
310 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  40.52 
 
 
309 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  37.55 
 
 
309 aa  201  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  46.06 
 
 
310 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  38.49 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  46.06 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  39.3 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  45.04 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  46.06 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  36.57 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  39.54 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  40.8 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 
302 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  40.93 
 
 
295 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  38.38 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  46.22 
 
 
309 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  46.06 
 
 
310 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  45.54 
 
 
299 aa  198  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3641  tRNA pseudouridine synthase B  41.53 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  41.24 
 
 
335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2428  tRNA pseudouridine synthase B  43.8 
 
 
337 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  38.22 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  41.53 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3579  tRNA pseudouridine synthase B  41.94 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.911389  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  45.04 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  34.8 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  52.09 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  43.93 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  39.93 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  39.93 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  46.75 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0587  tRNA pseudouridine synthase B  38.78 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3542  tRNA pseudouridine synthase B  41.53 
 
 
314 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  37.98 
 
 
305 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  40.07 
 
 
301 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3473  tRNA pseudouridine synthase B  41.53 
 
 
314 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  46.67 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  35.79 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  39.6 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  37.04 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  38.23 
 
 
302 aa  195  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  39.1 
 
 
304 aa  195  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  37.06 
 
 
305 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  39.6 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  38.7 
 
 
301 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  47 
 
 
299 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  42.58 
 
 
306 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  41.54 
 
 
302 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>