More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3527 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  353  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32.21 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 176 aa  84  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  31.72 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 120 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  28.66 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  30.52 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  34.82 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  32.64 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  31.1 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.1 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.29 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  19.5 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  25.34 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  29.41 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  33.61 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  40.65 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.71 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  28.97 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>