88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2778 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  43.51 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.18 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  39.71 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  42.59 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  27.18 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  34.02 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 364 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  31.03 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  36.92 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  32.43 
 
 		 749 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  25.49 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2888  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.48 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  30.49 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  35.62 
 
 		 476 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  29.76 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  30.23 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.11 
 
 		 370 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  32.79 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  29.36 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  34.07 
 
 		 353 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 117 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  33.33 
 
 		 120 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  32.39 
 
 		 155 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 127 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  34.67 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3039  cupin 2, barrel  32.35 
 
 		 134 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762499  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  30.23 
 
 		 135 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  38.98 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3851  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.9 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0747223 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  30.95 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  32.76 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3518  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  32.93 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  44.19 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  34.07 
 
 		 353 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  33.8 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  35.14 
 
 		 671 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 349 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2136  hypothetical protein  48.72 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 277 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0766  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 472 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  27.78 
 
 		 405 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 277 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.9 
 
 		 350 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 277 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  38.78 
 
 		 370 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1947  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.28 
 
 		 234 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  26.19 
 
 		 311 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0495  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.23 
 
 		 460 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  32.43 
 
 		 662 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 		 294 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  28.24 
 
 		 122 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 345 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>