More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2202 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  48.28 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  39.74 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  39.5 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  39.17 
 
 		 242 aa  151  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  38.24 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  41.2 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  40.6 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  36.55 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  38.24 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.24 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  41.74 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  38.86 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  38.52 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  40.95 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  35.87 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  36.05 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  35.19 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.6 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  37.02 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  34.08 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  33.62 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  33.18 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  33.62 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  31.28 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  32.02 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  41.94 
 
 		 198 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  35.62 
 
 		 153 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  37.06 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.51 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.51 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  28.7 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.69 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 		 152 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.99 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  33.1 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.19 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32.03 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.7 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  29.63 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.8 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.59 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.66 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  30.82 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  36.55 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  30.8 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  29.91 
 
 		 423 aa  72  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  29.86 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  28.48 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  27.35 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  31.29 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  28.82 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32.19 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 155 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.76 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  30.87 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 		 628 aa  65.5  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  29.25 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  32.85 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  31.91 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  32.41 
 
 		 133 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  29.17 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  30.46 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.11 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.28 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  32.89 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.86 
 
 		 769 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.53 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  27.74 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>