More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1540 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  55.57 
 
 		 624 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  56.97 
 
 		 608 aa  661    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  55.28 
 
 		 665 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  55.57 
 
 		 624 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  56.35 
 
 		 624 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  100 
 
 		 603 aa  1197    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  55.57 
 
 		 624 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  56.19 
 
 		 621 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.65 
 
 		 614 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.38 
 
 		 611 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  54.49 
 
 		 614 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  51.34 
 
 		 613 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  59.65 
 
 		 546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 613 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  52.6 
 
 		 613 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  57.83 
 
 		 550 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  54.86 
 
 		 551 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.68 
 
 		 553 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  52.8 
 
 		 582 aa  577  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  53.94 
 
 		 551 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  54.68 
 
 		 557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  54.13 
 
 		 553 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.56 
 
 		 552 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  54.87 
 
 		 551 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  47.59 
 
 		 551 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  46.79 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  46.88 
 
 		 543 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  47.35 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  45.97 
 
 		 545 aa  488  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  47.99 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  48.85 
 
 		 540 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  47.16 
 
 		 543 aa  485  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  48.79 
 
 		 538 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  45.83 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  45.83 
 
 		 540 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  48.15 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  47.12 
 
 		 531 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 563 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.15 
 
 		 531 aa  355  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  41.73 
 
 		 538 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  36.82 
 
 		 603 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.61 
 
 		 534 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  40 
 
 		 543 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  40 
 
 		 543 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  40 
 
 		 543 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  38.5 
 
 		 565 aa  347  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  41.59 
 
 		 560 aa  347  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.62 
 
 		 540 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  38.18 
 
 		 546 aa  343  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 544 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  40.85 
 
 		 548 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  36.5 
 
 		 545 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  40.93 
 
 		 557 aa  342  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.02 
 
 		 575 aa  340  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  39.77 
 
 		 539 aa  339  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  38.34 
 
 		 566 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  39.77 
 
 		 539 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  39.79 
 
 		 552 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.8 
 
 		 597 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  40 
 
 		 550 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 607 aa  336  7.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  41.05 
 
 		 585 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  36.86 
 
 		 547 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 554 aa  335  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  38.46 
 
 		 546 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  39.38 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  36.69 
 
 		 549 aa  335  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  39.61 
 
 		 532 aa  335  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  36.33 
 
 		 561 aa  335  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  35.5 
 
 		 571 aa  333  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  38.15 
 
 		 602 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  37.59 
 
 		 593 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  38.57 
 
 		 558 aa  333  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  41.65 
 
 		 540 aa  333  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  35.04 
 
 		 619 aa  333  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  36.27 
 
 		 575 aa  333  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  39.32 
 
 		 576 aa  332  9e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  39.7 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  37.21 
 
 		 571 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  39.6 
 
 		 546 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  39.89 
 
 		 538 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  42.44 
 
 		 534 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 571 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  41.18 
 
 		 559 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  39.26 
 
 		 545 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  40.81 
 
 		 559 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  38.48 
 
 		 539 aa  331  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  40.81 
 
 		 559 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  38.06 
 
 		 557 aa  330  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  40.51 
 
 		 534 aa  330  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  38.51 
 
 		 525 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.25 
 
 		 619 aa  329  8e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 		 546 aa  329  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  41.13 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  41.75 
 
 		 550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  36.97 
 
 		 557 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  35.26 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  35.61 
 
 		 571 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  35.02 
 
 		 572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  37.08 
 
 		 558 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>