89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1276 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 452 aa  887    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  51.03 
 
 		 417 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  50.91 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 419 aa  349  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  51 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 419 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 419 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 419 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  50 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 419 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 419 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  50.25 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  45.02 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 451 aa  309  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  42.05 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  48.62 
 
 		 372 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  34.31 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 439 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 439 aa  200  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 439 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  32.2 
 
 		 418 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 424 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 433 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 421 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  28.75 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 421 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  25.78 
 
 		 405 aa  97.8  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 428 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  24.4 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  27.36 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 		 402 aa  53.9  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 406 aa  47  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  24.69 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 384 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 414 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.79 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 416 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 386 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>