172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4144 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  70.41 
 
 		 300 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  68.14 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  68.14 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  67.91 
 
 		 298 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  64.71 
 
 		 291 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  58.5 
 
 		 297 aa  363  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  62.37 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  58.8 
 
 		 293 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  48.79 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  54.23 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  49.14 
 
 		 291 aa  298  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  53.9 
 
 		 289 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  54.26 
 
 		 289 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  49.14 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  52.84 
 
 		 289 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  48.97 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  50.71 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  51.2 
 
 		 289 aa  281  9e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  49.13 
 
 		 286 aa  271  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  47.95 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  45.7 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  39.72 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  36.21 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  39.51 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  34.28 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  31.49 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  36.75 
 
 		 265 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  31.45 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  30.9 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  36.82 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  29.65 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  34.72 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  35.05 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  29.07 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  32.69 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  30.72 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  33 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  32.48 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29.92 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  31.31 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  37.82 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  30.21 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.95 
 
 		 278 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  32.39 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  31.68 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  31.75 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  32.55 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  25.26 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  32.17 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  27.9 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  30.84 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  30.84 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  30.54 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  31.31 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.47 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  29.76 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  28.51 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  30 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  28.63 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  25.94 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  27.45 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  25 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  28 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  23.79 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.7 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  26 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.41 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  29.69 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  27.67 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  24.47 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  24.05 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>