94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2281 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 		 198 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  32.52 
 
 		 226 aa  92.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 219 aa  88.2  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 235 aa  87.8  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 196 aa  84.3  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 342 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
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NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
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NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  35.83 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  41.24 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2012  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  31.73 
 
 		 227 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 201 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 185 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 200 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 201 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
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NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  25.89 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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