More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1986 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1986  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 390 aa  790    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258537  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19090  cystathionine gamma-synthase  73.96 
 
 		 401 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5066  Cystathionine gamma-lyase  63.99 
 
 		 401 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  43.22 
 
 		 403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  41.01 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0098  cystathionine gamma-synthase  41.62 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  38.14 
 
 		 394 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  38.28 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  39.02 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  39.49 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.46 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  43.77 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  36.9 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  41.16 
 
 		 407 aa  249  8e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  39.33 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  36.69 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 388 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.61 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2896  Cystathionine gamma-synthase  41.33 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.063757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  38.12 
 
 		 378 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.24 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  38.68 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 390 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  41.56 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  38.79 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.34 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  36.13 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  40.92 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  38.27 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  36.11 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  43.28 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.14 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.12 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.14 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.59 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.12 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.3 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  33.25 
 
 		 392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.35 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  40.5 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.09 
 
 		 404 aa  235  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.53 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  37.69 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.82 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.9 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  35.9 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.8 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  38.27 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  37.69 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.24 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  40.77 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.52 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2132  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.55 
 
 		 422 aa  234  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.61 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.24 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  37.69 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  41.11 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.05 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  38.97 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.52 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.56 
 
 		 411 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39.28 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  36.34 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1237  cystathionine gamma-synthase  35.43 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  41.1 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  36.04 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.87 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  38.08 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  39.47 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  37.18 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.24 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.46 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  37.76 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.41 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.92 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.86 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  37.44 
 
 		 400 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  38.62 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  33.08 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  36.86 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  39.39 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 		 383 aa  226  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  38.21 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.9 
 
 		 389 aa  225  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  38.55 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  38.18 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  34.46 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  39.54 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  36.83 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  35.58 
 
 		 400 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  36.34 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  37.18 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  36.15 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>