212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1697 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1282    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  56.68 
 
 
644 aa  708    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  43.39 
 
 
632 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  42.38 
 
 
632 aa  445  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  41.04 
 
 
633 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  41.92 
 
 
634 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  43.04 
 
 
639 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  31.84 
 
 
634 aa  318  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  28.79 
 
 
631 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  28.43 
 
 
683 aa  187  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  30.04 
 
 
730 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  25.88 
 
 
637 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  29.74 
 
 
645 aa  167  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  31.62 
 
 
767 aa  167  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  32.97 
 
 
676 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  30.77 
 
 
653 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 
656 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  28.79 
 
 
767 aa  164  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  30.75 
 
 
645 aa  162  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  26.74 
 
 
674 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 
662 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  30.35 
 
 
684 aa  157  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  29.26 
 
 
673 aa  153  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  28.97 
 
 
705 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  30.29 
 
 
681 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  29.57 
 
 
667 aa  150  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  31.03 
 
 
635 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  26.08 
 
 
680 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  30.85 
 
 
730 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  27.65 
 
 
689 aa  145  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  30.51 
 
 
641 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  29.86 
 
 
667 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  27.59 
 
 
688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  28.74 
 
 
689 aa  142  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  31.25 
 
 
671 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  27.59 
 
 
688 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  29.54 
 
 
674 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  27.73 
 
 
673 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  29.54 
 
 
674 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  30.34 
 
 
685 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  30.34 
 
 
685 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  28.75 
 
 
672 aa  138  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  27.4 
 
 
689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  26.06 
 
 
696 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  32.84 
 
 
943 aa  133  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  26.87 
 
 
680 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  29.83 
 
 
662 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  38.76 
 
 
744 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  32.53 
 
 
649 aa  130  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
668 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  29.05 
 
 
726 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  30.9 
 
 
707 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  24.34 
 
 
691 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  25.89 
 
 
754 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  27.63 
 
 
732 aa  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  26.29 
 
 
662 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 
715 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.67 
 
 
715 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  27.76 
 
 
661 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  27.69 
 
 
669 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  24.66 
 
 
662 aa  121  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  25.29 
 
 
660 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  30.03 
 
 
709 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  31.33 
 
 
715 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  32.89 
 
 
734 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  25.97 
 
 
685 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  33.49 
 
 
739 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  33.49 
 
 
739 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  28.39 
 
 
706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  32.89 
 
 
734 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  44.29 
 
 
763 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  35.21 
 
 
668 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  30.45 
 
 
681 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  25.08 
 
 
803 aa  110  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  28.87 
 
 
742 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  26.46 
 
 
676 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  26.71 
 
 
698 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  40.71 
 
 
742 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  32.53 
 
 
737 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 
728 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  41.43 
 
 
742 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  41.43 
 
 
742 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  41.43 
 
 
742 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  40 
 
 
742 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  38.46 
 
 
720 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  40.71 
 
 
742 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  26.35 
 
 
764 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  34.27 
 
 
800 aa  101  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  25.68 
 
 
795 aa  101  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  36.09 
 
 
862 aa  100  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 
742 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  40 
 
 
742 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  39.29 
 
 
635 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  29.57 
 
 
790 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  36.84 
 
 
760 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  33.12 
 
 
806 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  22.24 
 
 
687 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  25.29 
 
 
692 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  39.26 
 
 
815 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  33.77 
 
 
890 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>