More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6630 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  922    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  26.48 
 
 		 493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  26.26 
 
 		 493 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.91 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  28.61 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.92 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.54 
 
 		 563 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.68 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  30.53 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  30.22 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.41 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.87 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.87 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.87 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  26.18 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.93 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.35 
 
 		 268 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  28.78 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.95 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.99 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  32.37 
 
 		 475 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  24.82 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  25.56 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  26.05 
 
 		 447 aa  90.5  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  24.59 
 
 		 416 aa  90.5  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  27.3 
 
 		 469 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.03 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  30.08 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  24.47 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.49 
 
 		 451 aa  86.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  24.16 
 
 		 433 aa  86.7  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  25.07 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  29.37 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  25.37 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  26.27 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  23.61 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  22.77 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  28.74 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  25.13 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  27.27 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  22.86 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.88 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  26.15 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  24.68 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  29.49 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.57 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  31.28 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  23.78 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  23.88 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  27.04 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  24.94 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  29.74 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  23.92 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  20.97 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  27.85 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  25 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  23.16 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  26.89 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0107  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  26.63 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  26.34 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  28.21 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  27.64 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  26.5 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.46 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  26.78 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0382  phenylacetate--CoA ligase  31.76 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  23.06 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  33.1 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  24.64 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  23.58 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  24.56 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  31.31 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  26.02 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  31.18 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  23.88 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  31.71 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  37.01 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  24.8 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  25.82 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  23.53 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  27.72 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  26.52 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  32 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  26.84 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.94 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  24.74 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  25.59 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.34 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.36 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.86 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  27.62 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  21.62 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  25.45 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.52 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  28.98 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>