More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5181 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4581  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  52.23 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  47.4 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 239 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 233 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 224 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  34.07 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  36.78 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4749  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 248 aa  48.5  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 287 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 230 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 219 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 451 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 424 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  38.71 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 451 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>