More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2205 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 317 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  73.48 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  59.93 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  59.55 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  59.8 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  58.22 
 
 		 335 aa  338  8e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  58.01 
 
 		 318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  57.28 
 
 		 305 aa  332  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  58.06 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  55.45 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  60.13 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  56.19 
 
 		 319 aa  318  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  56.37 
 
 		 315 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  58.69 
 
 		 306 aa  315  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  58.28 
 
 		 311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  57.42 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  54.46 
 
 		 308 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  56.33 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  40 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  41.27 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 		 319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  38.34 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  38.38 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  37.09 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  38.36 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  37.12 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  36.13 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  43.14 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.75 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 		 363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 		 426 aa  172  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  38.38 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 		 344 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  29.7 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  35.35 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  40.91 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  35.97 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  36.5 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  32.11 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  29.51 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  32.3 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  24.48 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  27.78 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  27.41 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  28.28 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  25.95 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.37 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  23.23 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.1 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  24.62 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  30 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  32.12 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.6 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  24.33 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  26.43 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  21.84 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.85 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  24.49 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  28.8 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  22.9 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  20.51 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  26.52 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  24.25 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  22.03 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  23.13 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.71 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  23 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  25.38 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  23.15 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>