More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1925 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 671 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  100 
 
 		 726 aa  1405    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  56.83 
 
 		 613 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  58.27 
 
 		 602 aa  661    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  58.63 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  50.73 
 
 		 589 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  52.37 
 
 		 609 aa  595  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  53.27 
 
 		 597 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  54.77 
 
 		 625 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  56.26 
 
 		 638 aa  588  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  55.32 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  55.59 
 
 		 625 aa  581  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  50.75 
 
 		 610 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.46 
 
 		 730 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.95 
 
 		 617 aa  500  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  47.05 
 
 		 605 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  48.04 
 
 		 635 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  47.56 
 
 		 608 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.76 
 
 		 606 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  40.2 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30.33 
 
 		 594 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  33.62 
 
 		 583 aa  275  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  33.28 
 
 		 1522 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  28.93 
 
 		 585 aa  266  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  29.8 
 
 		 606 aa  266  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 640 aa  262  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  38.36 
 
 		 984 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29.53 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  27.81 
 
 		 596 aa  258  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  29.83 
 
 		 593 aa  257  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 581 aa  257  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  35.1 
 
 		 631 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.04 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  28.6 
 
 		 593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.22 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  33.5 
 
 		 636 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  29.52 
 
 		 578 aa  253  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.61 
 
 		 627 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.18 
 
 		 606 aa  249  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.35 
 
 		 601 aa  248  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  32.24 
 
 		 641 aa  248  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  36.22 
 
 		 1231 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.04 
 
 		 585 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.38 
 
 		 631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  32.52 
 
 		 627 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  28.29 
 
 		 581 aa  245  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  35.33 
 
 		 628 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.91 
 
 		 575 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 604 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.23 
 
 		 650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.23 
 
 		 650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2272  ABC transporter related  31.44 
 
 		 613 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  28.34 
 
 		 585 aa  244  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.1 
 
 		 1257 aa  243  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  33.68 
 
 		 1284 aa  243  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  34.09 
 
 		 620 aa  242  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.63 
 
 		 579 aa  242  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  33.16 
 
 		 626 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  27.94 
 
 		 582 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  35.14 
 
 		 1321 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.74 
 
 		 622 aa  241  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  33.11 
 
 		 627 aa  241  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  33.11 
 
 		 627 aa  241  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  35.29 
 
 		 603 aa  241  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  30.1 
 
 		 583 aa  241  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  33.39 
 
 		 626 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  33.45 
 
 		 642 aa  240  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.05 
 
 		 641 aa  240  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 640 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.92 
 
 		 580 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  27.19 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  31.33 
 
 		 592 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  32.94 
 
 		 622 aa  239  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  33.58 
 
 		 578 aa  238  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  34 
 
 		 1301 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  28.73 
 
 		 586 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.32 
 
 		 583 aa  238  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.11 
 
 		 577 aa  237  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  34.08 
 
 		 607 aa  237  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  33.33 
 
 		 641 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  33.53 
 
 		 600 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.38 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  34.7 
 
 		 663 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0219  ABC transporter related  30.18 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.523639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  33.14 
 
 		 637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  30.78 
 
 		 583 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  30.38 
 
 		 588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  27.7 
 
 		 588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  28.25 
 
 		 589 aa  235  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  28.68 
 
 		 591 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  36.73 
 
 		 589 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.38 
 
 		 583 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  30.08 
 
 		 618 aa  234  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  32.04 
 
 		 632 aa  234  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  34.16 
 
 		 1436 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  35.73 
 
 		 639 aa  233  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  33.66 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  28.55 
 
 		 577 aa  233  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  32.88 
 
 		 633 aa  233  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.4 
 
 		 583 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>