184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1576 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1576  RND superfamily drug efflux protein  100 
 
 		 864 aa  1646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4078  putative integral membrane export protein  54.47 
 
 		 749 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  33.5 
 
 		 752 aa  283  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.49 
 
 		 735 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  32.79 
 
 		 758 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  33.12 
 
 		 737 aa  234  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.22 
 
 		 717 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.4 
 
 		 726 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  30.23 
 
 		 760 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31.47 
 
 		 718 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.3 
 
 		 781 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.75 
 
 		 729 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.41 
 
 		 731 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  28.83 
 
 		 743 aa  178  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.26 
 
 		 724 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  26.54 
 
 		 735 aa  173  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  29.52 
 
 		 734 aa  171  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  30.5 
 
 		 842 aa  171  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  30.11 
 
 		 749 aa  171  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  28.91 
 
 		 832 aa  169  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  31.01 
 
 		 876 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  30.98 
 
 		 755 aa  165  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  30.37 
 
 		 742 aa  165  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  27.37 
 
 		 920 aa  164  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  34.43 
 
 		 841 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  23.1 
 
 		 829 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  23.1 
 
 		 829 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  30.81 
 
 		 793 aa  154  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  30.81 
 
 		 734 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  27.81 
 
 		 728 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  30.62 
 
 		 751 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  27.5 
 
 		 787 aa  140  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  27.84 
 
 		 732 aa  140  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  28.16 
 
 		 740 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  29.61 
 
 		 724 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  21 
 
 		 893 aa  137  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  28.13 
 
 		 734 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  28.69 
 
 		 723 aa  134  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  27.24 
 
 		 807 aa  134  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  30.94 
 
 		 761 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  27.87 
 
 		 714 aa  128  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  28.37 
 
 		 737 aa  127  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  28.24 
 
 		 1002 aa  126  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  31.6 
 
 		 732 aa  126  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  27.8 
 
 		 735 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  29.47 
 
 		 743 aa  125  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  26.57 
 
 		 917 aa  125  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  27.33 
 
 		 903 aa  124  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  25.78 
 
 		 909 aa  122  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.25 
 
 		 746 aa  122  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  29.92 
 
 		 836 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  25.26 
 
 		 1058 aa  120  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  28.81 
 
 		 732 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  25.76 
 
 		 903 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  26.17 
 
 		 779 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.41 
 
 		 796 aa  114  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  26.08 
 
 		 750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1092 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  26.82 
 
 		 729 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  26.8 
 
 		 772 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  26.8 
 
 		 772 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  26.8 
 
 		 772 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  26.05 
 
 		 734 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  29.12 
 
 		 854 aa  111  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  26.98 
 
 		 735 aa  110  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  22.24 
 
 		 704 aa  108  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  27.51 
 
 		 978 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  27.98 
 
 		 715 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  22.47 
 
 		 758 aa  104  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  23.9 
 
 		 740 aa  102  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  28.25 
 
 		 723 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.17 
 
 		 1382 aa  99  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  26.4 
 
 		 779 aa  98.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  31.65 
 
 		 711 aa  97.4  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  30.84 
 
 		 776 aa  96.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  27.82 
 
 		 968 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  26.22 
 
 		 717 aa  96.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  26.37 
 
 		 787 aa  94.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  28.66 
 
 		 966 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  24.96 
 
 		 733 aa  92.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  28.55 
 
 		 738 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  26.89 
 
 		 726 aa  90.1  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  27.33 
 
 		 743 aa  89.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  28.93 
 
 		 843 aa  88.6  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  25.66 
 
 		 958 aa  86.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  27.62 
 
 		 979 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  27.62 
 
 		 983 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  27.62 
 
 		 983 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  27.23 
 
 		 766 aa  84.3  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  25.97 
 
 		 710 aa  84.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.8 
 
 		 1308 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  25.15 
 
 		 791 aa  81.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  28.33 
 
 		 847 aa  81.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  29.37 
 
 		 840 aa  81.3  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  23.49 
 
 		 1095 aa  80.1  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  26.65 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  26.1 
 
 		 744 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  28.66 
 
 		 784 aa  77.8  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  25.32 
 
 		 718 aa  77  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  21.41 
 
 		 741 aa  74.3  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>