More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0382 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0382  ABC transporter related  100 
 
 		 538 aa  1001    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  43.52 
 
 		 823 aa  317  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  44.3 
 
 		 827 aa  316  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  43.7 
 
 		 823 aa  316  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  40.52 
 
 		 832 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  43.51 
 
 		 822 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  40.72 
 
 		 830 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  40.12 
 
 		 828 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  37.66 
 
 		 859 aa  259  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  40.61 
 
 		 1302 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  39.69 
 
 		 573 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  34.62 
 
 		 502 aa  239  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  35.32 
 
 		 502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  35.18 
 
 		 840 aa  233  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  36.1 
 
 		 490 aa  229  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  34.1 
 
 		 494 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  35.07 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  36.22 
 
 		 842 aa  226  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  34.03 
 
 		 840 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  35.53 
 
 		 873 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  32.41 
 
 		 555 aa  224  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  34.08 
 
 		 852 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  33.2 
 
 		 838 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  34.94 
 
 		 840 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  34.91 
 
 		 505 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  32.72 
 
 		 536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  34.59 
 
 		 863 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  35.89 
 
 		 504 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4485  ABC transporter related  52.46 
 
 		 250 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4484  ABC transporter related  50.43 
 
 		 241 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  50.23 
 
 		 249 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  45.53 
 
 		 234 aa  181  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  45.92 
 
 		 235 aa  178  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 236 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  45.65 
 
 		 229 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  46.58 
 
 		 989 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.53 
 
 		 234 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1099  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 		 242 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 251 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 234 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 924 aa  169  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  40 
 
 		 259 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  38.89 
 
 		 233 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 233 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1197  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 242 aa  169  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 235 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  38.56 
 
 		 237 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  41.1 
 
 		 243 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 235 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  44.07 
 
 		 238 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  39.57 
 
 		 238 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  42.13 
 
 		 235 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 237 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  43.83 
 
 		 235 aa  167  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  40.5 
 
 		 260 aa  167  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  42.67 
 
 		 334 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  42.37 
 
 		 236 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  38.98 
 
 		 236 aa  166  9e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4565  ABC transporter related  46.02 
 
 		 236 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3101  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 241 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  45.92 
 
 		 234 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  42.8 
 
 		 234 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  39.83 
 
 		 234 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.72 
 
 		 238 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  47.06 
 
 		 244 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  44.92 
 
 		 237 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  45.11 
 
 		 233 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  46.26 
 
 		 238 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  44.68 
 
 		 233 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  44.26 
 
 		 233 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  44.26 
 
 		 233 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  44.26 
 
 		 233 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  38.3 
 
 		 238 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  44.4 
 
 		 264 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  38.82 
 
 		 237 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  44.3 
 
 		 234 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 294 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  44.26 
 
 		 233 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  44.26 
 
 		 233 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  38.72 
 
 		 238 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 234 aa  163  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 233 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  41.28 
 
 		 238 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  41.53 
 
 		 244 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.26 
 
 		 233 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  40.85 
 
 		 233 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  37.66 
 
 		 249 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  44.68 
 
 		 233 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  39.57 
 
 		 238 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  40.25 
 
 		 238 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  39.84 
 
 		 254 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  40.25 
 
 		 238 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  42.98 
 
 		 237 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1134  ABC transporter related  42.55 
 
 		 243 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.767247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  38.71 
 
 		 283 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  41.1 
 
 		 238 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>