275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3925 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3925  putative fimbrial assembly chaperone FanE  100 
 
 		 226 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4580  chaperone protein ClpE  38.32 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  36.44 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  31.86 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  31.53 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  29.86 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  28.38 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.31 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  29.36 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  33.52 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  33.52 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  31.39 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  33.52 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.78 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  32.95 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  32.26 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  33.8 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  28.7 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  31.8 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  36.16 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  28.31 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  32.51 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  36.16 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  36.16 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  29.3 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  36.16 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  31.4 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  28.83 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  30.88 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  28.39 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  30.92 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  32.56 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  29.57 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  32.56 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  28.51 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.35 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  31.65 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.83 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  30.43 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  31.2 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  30.92 
 
 		 243 aa  98.6  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  29.89 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  29.71 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  30.68 
 
 		 248 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  29.89 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  31.06 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  27.7 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  31.06 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  31.06 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.61 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.58 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  31.42 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  28.77 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  31.42 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  24.67 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.77 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  30.43 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.4 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.35 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  27.78 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  30.4 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  33.67 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  30.4 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  30.4 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  30.4 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  29.28 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  30.66 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  29.65 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  30.8 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  29.29 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  30.95 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  27.19 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  29.29 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.21 
 
 		 252 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  35.37 
 
 		 256 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  35.37 
 
 		 256 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  35.37 
 
 		 256 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  27.49 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  29.61 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  29.52 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  27.49 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  29.29 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  35.37 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  27.49 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.44 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.98 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  32.16 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  27.49 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  27.8 
 
 		 266 aa  92  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  32.16 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  33.33 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0302  pili assembly chaperone  25.74 
 
 		 244 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  29.95 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.87 
 
 		 248 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  28.76 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  31.58 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  26.87 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  27.49 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.32 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  31.58 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>