88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1657 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  78.13 
 
 		 583 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  59.4 
 
 		 948 aa  907    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1039 aa  2062    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  68.43 
 
 		 949 aa  1317    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  73.95 
 
 		 948 aa  1435    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  57.7 
 
 		 948 aa  904    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.91 
 
 		 947 aa  141  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  35.84 
 
 		 1526 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.84 
 
 		 1526 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  35.34 
 
 		 1571 aa  135  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.25 
 
 		 1748 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1565 aa  131  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  30.13 
 
 		 1099 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  29.91 
 
 		 863 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  29.95 
 
 		 863 aa  122  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  29.95 
 
 		 836 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  29.95 
 
 		 836 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.95 
 
 		 836 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  29.77 
 
 		 863 aa  121  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  29.73 
 
 		 1753 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  27.61 
 
 		 1115 aa  112  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.85 
 
 		 1770 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  26.85 
 
 		 1770 aa  108  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.16 
 
 		 1762 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.16 
 
 		 1762 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.26 
 
 		 1763 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.8 
 
 		 1067 aa  104  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.44 
 
 		 1070 aa  102  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2377  hypothetical protein  30.32 
 
 		 418 aa  100  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000029957  normal  0.0111859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.06 
 
 		 1070 aa  100  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1976  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 		 418 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000418237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1744  hypothetical protein  30.71 
 
 		 418 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1965  hypothetical protein  30.71 
 
 		 418 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.646442  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1878  hypothetical protein  30.71 
 
 		 418 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000220122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1862  hypothetical protein  30.71 
 
 		 418 aa  95.9  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000261063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01635  hypothetical protein  30.71 
 
 		 418 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.629129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01625  hypothetical protein  30.71 
 
 		 418 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1533  hypothetical protein  30.18 
 
 		 418 aa  94.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  hitchhiker  0.00188577 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  27.96 
 
 		 1093 aa  94.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  27.96 
 
 		 1093 aa  94.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 		 825 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  25.93 
 
 		 1040 aa  92.8  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  29.81 
 
 		 819 aa  92  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.19 
 
 		 1741 aa  80.1  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  27.06 
 
 		 1234 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  29.37 
 
 		 818 aa  79  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  25.45 
 
 		 924 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  31.23 
 
 		 1049 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  27.38 
 
 		 914 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  25.14 
 
 		 1594 aa  72.4  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.05 
 
 		 1357 aa  72  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  29.95 
 
 		 909 aa  70.1  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  25.4 
 
 		 1593 aa  66.6  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.74 
 
 		 1197 aa  64.3  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.75 
 
 		 1009 aa  63.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  26.36 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  25.76 
 
 		 1971 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 		 864 aa  61.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.93 
 
 		 1055 aa  60.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  26.11 
 
 		 773 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  25.08 
 
 		 989 aa  58.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1165 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  24.2 
 
 		 997 aa  57.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1165 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  24.2 
 
 		 1004 aa  57.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.71 
 
 		 1023 aa  57  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  32.81 
 
 		 927 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  41.33 
 
 		 3635 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  24.65 
 
 		 1113 aa  53.5  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  30.1 
 
 		 1571 aa  53.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  31.52 
 
 		 995 aa  52.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  25.07 
 
 		 1277 aa  52  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  24.68 
 
 		 2926 aa  51.6  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  57.5 
 
 		 2396 aa  51.2  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  28.65 
 
 		 1441 aa  50.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  26.46 
 
 		 1102 aa  50.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  27.68 
 
 		 1579 aa  49.7  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  23.05 
 
 		 820 aa  49.7  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  53.85 
 
 		 5613 aa  48.9  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  37.29 
 
 		 1446 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.1 
 
 		 868 aa  48.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  39.66 
 
 		 1472 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.37 
 
 		 3322 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  35.14 
 
 		 2906 aa  46.2  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  27.34 
 
 		 1541 aa  46.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  24.94 
 
 		 1012 aa  45.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  53.06 
 
 		 1009 aa  45.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  40.68 
 
 		 2505 aa  44.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>